Сформировано 2 июля 1959 года в результате объединения 2-го, 3-го, 4-го, 5-го и 6-го спецотделов КГБ. 1 ноября 1991 г. передано в КГБ РСФСР.

В/ч 68240.

Кураторы:
ИВАШУТИН Петр Иванович (31 августа 1959 – 9 декабря 1961 г.), 1-й заместитель председателя КГБ при СМ СССР;
ПЕРЕПЕЛИЦЫН Александр Иванович (9 декабря 1961 – 4 октября 1963 г.), заместитель председателя КГБ при СМ СССР;
ПАНКРАТОВ Лев Иванович (4 октября 1963 – 8 июля 1971 г.), заместитель председателя КГБ при СМ СССР;
ЧЕБРИКОВ Виктор Михайлович (30 ноября 1971 – ... г.), заместитель председателя КГБ при СМ СССР;

Начальники:
1. ЛЯЛИН Серафим Николаевич (25 августа 1959 – 16 марта 1961 г.), генерал-майор;
2. ПАТРУХИН Константин Николаевич (29 июля 1961 – 17 декабря 1964 г.), инженер-полковник;
3. ГОЦИРИДЗЕ Отар Давидович (17 декабря 1964 – 15 мая 1970 г.), полковник, с 20 декабря 1966 г. – генерал-майор;
4. ЕРМАКОВ Михаил Иванович (19 мая 1970 – 2 февраля 1979 г.), генерал-майор, с 18 декабря 1974 г. – генерал-лейтенант-инженер;
5. ДЕМИН Виктор Павлович (февраль 1979 – 1991 г.), генерал-майор, генерал-лейтенант;
6. БЫКОВ Андрей Петрович (1991 г.), генерал-майор;

С.Н.Лялин	О.Д.Гоцеридзе	М.И.Ермаков
Демин В.П.	А.П.Быков

1-е заместители начальника:
ФИЛИППОВСКИЙ Владимир Владимирович
ВОЙКО Евгений Михайлович (октябрь – декабрь 1991 г.), полковник;

1-е заместители начальника – Главные инженеры:
ДЕМИН Виктор Павлович (1972 – февраль 1979 г.)

Заместители начальника:
НИКИФОРОВ Андрей Васильевич (март 1962 – февраль 1969 г.), полковник;
НИКИФОРОВ С. (на 1980 г.), генерал-майор;
КУЯРОВ А.Н.
ПОНОМАРЕНКО Борис Федосеевич (... – 1991 г.), полковник;
БЫКОВ Андрей Петрович (1986 – 1991 г.)

Заместители начальника – начальники 6-го отдела (службы):
(Должность введена в январе 1976 г.)
1. ВИНОГРАДСКИЙ В.Н. (январь 1976 – на 1985 г.)

Филипповский В.В.	Е.М.Войко	Демин В.П.
А.В.Никифоров	Б.Ф.Пономаренко	А.П.Быков

• 1-й отдел (режимно-секретный) [1]
• 2-й отдел (литерные мероприятия, такие как прослушивание телефонов и помещений)
• 3-й отдел (изготовление средств тайнописи, документов для оперативных целей, экспертиза документов и почерков)
• 4-й отдел (радиоконтрразведка)
• 5-й отдел (изготовление опертехники)
• 6-й отдел (почтовый контроль)
• Центральный НИИ специальной техники (ЦНИИСТ)

В 1964 г. 4-й отдел был передан в 8-е Главное управление;

Приказом КГБ №00147 от 20 ноября 1967 г. 2-й отдел был выведен из состава ОТУ и преобразован в 12-й отдел КГБ при СМ СССР.

5 мая 1969 г. был создан НИИАИ (внедрение ЭВМ и создание автоматизированной системы информационного обеспечения);

В сентябре 1977 г. был создан Центральный НИИ специальных исследований (ЦНИИСИ);

В 1979 г. был создан саперный отдел;

В июне 1983 г. 6-й отдел был преобразован в 6-ю службу.

[1] Предположительно;