Оперативный (наружная разведка, обыски, аресты, установки). В начальный период войны часть отдела была эвакуирована из Москвы в Свердловск и Куйбышев.

После выделения НКГБ отдел был разделен на 12-й отдел 2-го Управления и 7-й отдел 3-го Управления НКГБ СССР.

Начальники:
1. КУБАТКИН Петр Николаевич (31 июля – 23 августа 1941 г.), старший майор ГБ;
2. ШЕРЕДЕГА Иван Самсонович (24 сентября – 25 октября 1941 г.), генерал-майор;
3. САЗЫКИН Николай Степанович (25 октября 1941 – май 1943 г.), комиссар ГБ 3-го ранга;

П.Н.Кубаткин	И.С.Шередега	Н.С.Сазыкин

Заместители начальника:
РОДОВАНСКИЙ Яков Федорович (1 декабря 1941 – 12 мая 1943 г.), старший майор ГБ, с 14 февраля 1943 г. – комиссар ГБ;

Помощники начальника:
РОДОВАНСКИЙ Яков Федорович (8 августа – 1 декабря 1941 г.), старший майор ГБ;
СЕНЕНКОВ Алексей Федотович (8 августа – сентябрь 1941 г.), капитан ГБ;
ИВАНОВ Василий Петрович (8 августа 1941 – 16 мая 1943 г.), старший лейтенант ГБ, с 16 апреля 1942 г. – капитан ГБ, с 11 февраля 1943 г. – подполковник ГБ;
ЖЕМБРОВСКИЙ Николай Константинович (июнь 1942 – 16 мая 1943 г.), старший лейтенант ГБ, с февраля 1943 г. – майор ГБ, с 5 марта 1943 г. – подполковник ГБ;

Я.Ф.Родованский	А.Ф.Сененков	В.П.Иванов	Н.К.Жембровский

Структура:
(на 20 мая 1942 г.)

• Руководство (начальник, заместители и помощники начальника, партком)
• Секретариат
• Группа учета
• Машбюро
• 1-е отделение (наружная разведка)
• 2-е отделение (наружная разведка)
• 3-е отделение (наружная разведка)
• 4-е отделение (наружная разведка)
• 5-е отделение (опертехника)
• 6-е отделение (наружная разведка)
• 7-е отделение (наружная разведка)
• 8-е отделение (наружная разведка)
• 9-е отделение (агентурные установки)
• 10-е отделение (агентурные установки)
• 11-е отделение (оперативный розыск)
• 12-е отделение (агентурное осведомление)
• 13-е отделение (аресты и обыски)
• 14-е отделение (кадры)
• 15-е отделение (автотехническое)
• 16-е отделение (хозяйственно-финансовое)

Численность: 64 чел. по штату на 20 мая 1942 г.

Источники: С.Чертопруд, НКВД-НКГБ в годы Великой Отечественной войны; Н.В.Петров, К.В.Скоркин, Кто руководил НКВД, 1934–1941; Н.В.Петров, Кто руководил органами госбезопасности, 1941 – 1954 : Справочник;