Сектор ВМС был создан 5 апреля 1950 г. постановлением Политбюро ЦК ВКП(б). 1 июля 1952 г. вошел в состав подотдела кадров Военного министерства и Военно-Морского министерства и переименован в сектор кадров ВМС. После ликвидации подотделов в апреле 1953 г. – вновь сектор ВМС. В 1956 г. переименован в сектор ВМФ. К 1966 г. был объединен с сектором ВВС в сектор ВВС и ВМФ, ПВО и гражданской авиации.

Заведующие:
ВЛАСОВ Иван Федорович (14 ноября 1949 – 22 октября 1952 г.), полковник;
ШИЛИН Арсений Захарович (1 июня 1954 – 27 октября 1955 г.), капитан 1-го ранга;

А.З.Шилин

Заместители заведующего:
ШИЛИН Арсений Захарович (28 ноября 1951 – 1 июня 1954 г.)

А.З.Шилин