Передано из МВД в КГБ 2 апреля 1957 г. совместным приказом МВД/КГБ. Срок обучения – 3 года. 16 апреля 1966 г. преобразовано в Высшее пограничное командное училище с 4-летним сроком обучения.

Награды: орден Красного Знамени (19 декабря 1967 г.), орден МНР «Боевые Заслуги» (май 1982 г.), орден Октябрьской Революции (11 февраля 1982 г.). С 7 июля 1977 г. – им.Моссовета.

Начальники:
1. ЛУКАШЕВ Василий Васильевич (1957 – 1959 г.), генерал-майор;
2. ДЕМШИН Илья Иванович (1959 – 1966 г.), генерал-лейтенант;
3. АЛЕЙНИКОВ Геннадий Ионович (1966 – 1977 г.), генерал-майор;
4. ТОЛКУНОВ Владимир Павлович (1977 – 1987 г.), генерал-майор;
5. КАРПОВ Иван Григорьевич (1987 – 1991 г.), генерал-лейтенант;
6. БОГАНЦЕВ Валентин Владимирович (1991 г.), генерал-лейтенант;

В.В.Лукашев	И.И.Демшин	Г.И.Алейников
В.П.Толкунов	И.Г.Карпов	В.В.Боганцев

Заместители начальника:
КОЗЕЛ Виктор Иванович, полковник

Заместители начальника – начальники учебного отдела:
ИВАНОВ Константин Ильич, полковник;
ГОРЛИНСКИЙ Феликс Николаевич, полковник
ПОДТЯГИН Лев Николаевич (... – 1987 г.), полковник

Начальники политотдела, затем заместители начальника по политчасти – начальники политотдела:
(С 1991 г. – начальники отделения по работе с личным составом)
1. ЕРМОШИН Иван Петрович (1957 – 1960 г.), полковник;
2. ОГОЕВ Маирбик Николаевич (1960 – 1961 г.), подполковник;
МИХАЙЛОВ Анатолий Елисеевич (1966 – ... г.), генерал-майор;
БОЛДИН Константин Николаевич (... – 1972 г.), генерал-майор;
НАГЛЫЙ Иван Иванович (1972 – ... г.), генерал-майор;
ТРЕГУБОВ Александр Ильич (на 1977 г.), полковник;
ЧЕРЕЧУКИН Василий Иванович (апрель 1978 – 1985 г.), генерал-майор;
КОЛЕСНИК Станислав Николаевич
САПОЖНИКОВ Сергей Артемович, полковник;
ШТЫКУЛИН Сергей Анатольевич (1991 г.), полковник;

Заместители начальника – начальники штаба местной обороны:
(должность введена в 1969 г.)
НАЗАРОВ Павел Романович (1969 – 1980 г.), полковник;
ТИТАРЕНКО Николай Алексеевич (1980 – ... г.), генерал-майор;
КОРЯКИН Юрий Михайлович, полковник;
ЕРКОВ Николай Васильевич, полковник;
БРАТЧИКОВ Владимир Николаевич, подполковник;

Заместители начальника по МТО:
ТРОФИМОВ Александр Иванович, полковник
ШРАМКО Вадим Викторович, подполковник
ДЖАБУА Анатолий Аксентьевич, подполковник, полковник;
ЧУРСИН Николай Григорьевич, подполковник;

Заместители начальника по научной работе:
КИСЛОВСКИЙ Юрий Григорьевич (... – 1989 г.), полковник;

Заместители начальника по технической части:
(должность введена в 1974 г.)
МУКОВОЗ Леонид Васильевич, полковник;
ЩУР Петр Александрович, полковник;
МИТАНЕВ Анатолий Иванович, подполковник, полковник;

Начальники отделения (отдела) кадров:
ПАПАНЬЯНЦ А.С., подполковник;

Ф.Н.Горлинский	И.И.Наглый	В.И.Черечукин
П.Р.Назаров	Н.А.Титаренко

Структура:

В 1965 г. на базе пограничного факультета Высшей школы КГБ были созданы Высшие пограничные командные курсы;

В 1966 г. предметные циклы были преобразованы в кафедры и группы. Структура училища приобрела вид:

• Командование
• Учебный отдел
• Политотдел
• Отделение кадров
• Курсантские подразделения
• Кафедра службы и тактики пограничных войск
• Кафедра общевойсковых дисциплин
• Кафедра огневой подготовки
• Кафедра физической подготовки и спорта
• Кафедра марксизма-ленинизма
• Кафедра высшей математики и теоретической механики
• Кафедра физики
• Кафедра химии
• Кафедра иностранных языков
• Группа преподавателей дисциплин связи
• Высшие пограничные командные курсы
• Полевой учебный центр «Ярославль»

Впоследствии происходили следующие изменения:

• Отделение кадров было преобразован в отдел;
• В 60-е – 70-е гг. был создан Спецкурс – подготовка курсантов из Венгрии, Болгарии, Монголии;
• 7 апреля 1969 г. из состава училища были выведены ВПКК;
• В декабре 1973 г. была создана кафедра военно-технической подготовки;
• В 1975 г. спецкурс был преобразован в спецдивизион. С 1977 г. на нем учились также курсанты из Кубы, затем Лаоса;
• В 1979 г. была создана адъюнктура;
• 12 июня 1981 г. группа преподавателей дисциплин связи была преобразована в кафедру связи;
• В 1982 г. спецдивизион был преобразован в спецфакультет, созданы кафедры специальных юридических дисциплин и партийно-политической работы, военной педагогики и военной психологии;
• В мае 1988 г. адъюнктура была передана в ВПКК;
• В 1990 г. кафедра военно-технической подготовки была преобразована в кафедру технических средств охраны границы, кафедра партийно-политической работы, военной педагогики и военной психологии – в кафедру военно-политической работы, военной педагогики и военной психологии;
• В 1991 г. Политотдел был преобразован в отделение по работе с личным составом;

Также в училище были организованы экстернат за среднее военное училище, сборы для подготовки офицеров к поступлению в военные академии Советской Армии, двухгодичный университет повышения педагогического мастерства офицерско-преподавательского состава, курсы подготовки военнослужащих погранвойск по специальной программе.

Выпускники училища, занимавшие руководящие должности в КГБ:

Выпуск 1957 г.

• Румянцев Г.Н.

Выпуск 1960 г.:

• Каландин А.П.

Выпуск 1961 г.:

• Кусилов В.К.

Выпуск 1962 г.:

• Борзунов А.С.
• Морковкин В.Ф.

Выпуск 1964 г.:

• Мустафин И.Г.

Выпуск 1968 г.:

• Земцов В.И.

Выпуск 1969 г.:

• Вахренев В.Н.

Выпуск 1970 г.:

• Банных В.И.
• Грицан В.Ф.

Выпуск 1972 г.:

• Валиев М.М.