Создан совместным приказом НКВД и НКГБ СССР № 004/002 от 4 января 1946 года на базе аппарата Уполномоченного НКВД по Восточной Пруссии.

После включения Восточной Пруссии в состав РСФСР в качестве Кенигсбергской (с 4 июля 1946 г. – Калининградской) области на базе аппарата уполномоченного были сформированы областные органы внутренних дел и госбезопасности: 16 мая 1946 г. – опергруппа (затем Управление) МГБ, а 24 мая 1946 г. – УМВД по Кенигсбергской области. Приказом МВД №1151 от 8 августа 1946 г. должность уполномоченного была упразднена.

Уполномоченные:
1. ТРОФИМОВ Борис Петрович (4 января – 8 августа 1946 г.), генерал-майор;

Б.П.Трофимов

Заместители уполномоченного:
РУДАКОВ Евгений Васильевич (4 января – 16 мая 1946 г.), полковник;
НАВАЛИХИН Степан Игнатьевич (4 января – 8 августа 1946 г.), подполковник милиции;

Е.В.Рудаков	С.И.Навалихин

Структура:

• 1-й отдел (следственный)
• 2-й отдел (оперативный)
• 3-й отдел (милиции)
• Отдел по делам военнопленных и интернированных
• Финансовый отдел
• Хозяйственный отдел
• Отдел кадров
• Тюремное отделение
• Учетное отделение
• Отделение МТО
• Автотехническое отделение
• Строительное отделение
• Санитарное отделение
• Отделение фельдсвязи
• Отделение по обслуживанию ведомственной телефонной станции.

Органы на местах:

• Кенигсбергский оперсектор
• Земландский оперсектор

Отделению также подчинялись. лагеря для военнопленных и интернированных №445 (Инстербург) и №533 (Прейсиш-Элау) и 3 тюрьмы (2 в Кенигсберге, 1 в Инстербурге)

Источник: Юрий Ржевцев, полковник милиции