Эскадрилья сформирована в 1986 г. на базе авиазвена 26-го ПОГО. Дислоцировалась в Одессе. Входила в состав Западного пограничного округа КГБ.

В/ч 9997

Командиры:
1. ТРЕТЬЯКОВ Леонтий Александрович (1986 – 1989 г.), полковник;
2. ГАРЕЕВ Шамиль Хасанович (1989 – 1991 г.)

Заместители командира:
ПОМЫТКИН Анатолий Никандрович (1988 – ... г.), подполковник;

Структура

Штат части утвержден 7 мая 1986 г.

• Управление
• 2 авиаотряда (самолеты Ан-24 и Ан-26)
• 2 авиазвена (вертолеты Ми-8)
• Инженерно-авиационная служба
• Технико-эксплуатационная часть
• Рота аэродромного обслуживания

В августе 1991 г. на вооружение эскадрильи стали поступать самолеты Ан-72 для замены Ан-24.