Создано приказом НКВД №00150 от 19 января 1942 г. в результате разделения Главного управления внутренних войск на Управления войск НКВД по охране железных дорог, войск НКВД по охране особо важных предприятий промышленности и конвойных войск. 7 декабря 1946 г. объединено с Управлением войск МВД по охране особо важных предприятий промышленности в Управление войск МВД по охране особо важных предприятий промышленности и железных дорог.

Начальники:
1. КУРЛЫКИН Арсений Павлович (19 января 1942 – 19 июля 1943 г.), комбриг, с 24 января 1942 г. – генерал-майор;
2. ФИЛИППОВ Тарас Филиппович (19 июля 1942 – 31 декабря 1946 г.), генерал-майор, с 8 апреля 1944 г. – генерал-лейтенант;

А.П.Курлыкин	Т.Ф.Филиппов

Заместители начальника:
СЛАДКЕВИЧ Моисей Иосифович (7 апреля 1942 – 28 октября 1944 г.), генерал-майор;
МАЖИРИН Федор Максимович (апрель 1945 – декабрь 1946 г.), генерал-майор;

Заместители начальника по политической части – начальники политотдела:
(должность введена в октябре 1942 г.)
БОРИСОГЛЕБСКИЙ Евгений Иванович (15 октября 1942 – 21 сентября 1946 г.), бригадный комиссар, с 20 декабря 1942 г. – генерал-майор;

Заместители начальника по кадрам:
АЖНИН Павел Владимирович (1942 – на 1944 г.), полковой комиссар, с декабря 1942 г. – полковник;

М.И.Сладкевич	Ф.М.Мажирин	Е.И.Борисоглебский

Структура:
(на май 1942 г.)

• Командование
• Секретариат
• Оперативный отдел
• Организационно-строевой отдел
• Отдел боевой подготовки
• Отдел по начсоставу
• Отдел службы тыла
• Автобронепоездная служба
• Служба связи
• Служба ПВО
• Инженерная служба
• Химическая служба
• Служба служебных собак
• Санитарная служба
• Ветеринарная служба

В октябре 1942 г., в связи с расформированием Политуправления войск НКВД, был создан политотдел Управления;

Численность, чел.: